非人鼠物种大染色体基因组拆分说明
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字数: 293 字
更新: 2025-09-02
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问题背景描述
SeekSoulTools、SeekArcTools和SeekSpaceTools软件对其中RNA表达文库分析过程均包含STAR比对，均要用到samtools index命令。
WARNING
由于samtools不支持大染色体的index操作，所以软件会报错，报错内容如下：
samtools index介绍说明如下：
http://www.htslib.org/doc/1.17/samtools-index.html
IMPORTANT
所以需要对大染色体进行拆分处理。处理过程示意图如下：
参考脚本和使用说明
参考脚本 - 点击查看脚本
TIP
建议在处理非人鼠物种数据前，先检查染色体长度，如超过阈值请使用拆分脚本进行处理。