数据集四_SeekOne DD单细胞3' 转录组
时长: 3 分钟
字数: 546 字
更新: 2025-07-14
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样品来源一:
健康人PBMC样品
实验方法:
使用SeekOne® DD单细胞3' 转录组试剂盒,按照说明书的要求在 SeekOne® Digital Droplet System 数字液滴仪上完成单细胞的分离、核酸标记、捕获等程序,所生成的高通量单细胞转录组文库使用真迈生物SURFSeq 5000平台进行测序。
数据分析:
使用Bcl2fastq将下机原始数据转换成fastq格式文件,并使用fastp质量过滤软件过滤掉低质量的测序数据。过滤后的测序结果使用SeekSoul Tools工具进行单细胞数据分析,并生成单细胞文库质控结果、表达矩阵以及比对结果等中间文件。
数据下载:
分析报告:下载
表达矩阵:matrix:下载
表达矩阵:RDS:下载
原始数据:下载
样品来源二:
健康人PBMC样品
实验方法:
使用SeekOne® DD 单细胞3' 转录组试剂盒,按照说明书的要求在 SeekOne® Digital Droplet System 数字液滴仪上完成单细胞分离、核酸标记、捕获等程序,所生成的高通量单细胞转录组文库使用Illumina NovaSeq 6000平台进行测序。
数据分析:
使用Bcl2fastq将下机原始数据转换成fastq格式文件,并使用fastp质量过滤软件过滤掉低质量的测序数据。过滤后的测序结果使用SeekOne® Tools工具进行单细胞数据分析,并生成单细胞文库质控结果、表达矩阵以及比对结果等中间文件。