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数据集八—SeekOne® DD FFPE单细胞转录组:

作者: SeekGene
时长: 2 分钟
字数: 291 字
更新: 2025-07-14
阅读: 0 次

样品来源:

2013年1月包埋的肺癌脑转移石蜡样本

实验方法:

使用SeekOne® DD FFPE样本单细胞转录组试剂盒,按照说明书要求完成体外RT、油包水连接、解交联&二次RT以及文库构建等流程,所生成的高通量单细胞转录组文库使用Illumina测序平台进行测序。

数据分析:

使用Bcl2fastq将下机原始数据转换成fastq格式文件,并使用fastp质量过滤软件过滤掉低质量的测序数据。过滤后的测序结果使用SeekSoul Tools工具进行单细胞数据分析,并生成单细胞文库质控结果、表达矩阵以及比对结果等中间文件。

数据下载:

分析报告:下载

细胞类型注释:下载

表达矩阵:matrix:下载

原始数据:下载

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