SeekSoul Online 版本更新
V5.5.2.250903
更新内容:
一、系统
1.1 使用邮箱验证时，发送验证码的接收邮箱。使用用户名绑定的邮箱，而不是用户名（部分用户名不是邮箱，发送验证码报错）；
1.2 中英文版本中，如果验证方式选择邮箱后，则隐藏手机号字段。
1.3 公司logo换成英文版，优化英文版操作逻辑和展示；
V5.5.1.250806
更新日期：2025年08月06日
更新内容:
一、资源总览
【我的数据】： 优化我的数据列表加载速度；scATAC产品新增_GE样本的矩阵和原始矩阵数据；
【分析流程】：优化复制流程的bug；
【分析流程-高级分析】：TCR的分组因子参数，限制不可选择Sample；monocle2的筛选因子和筛选对象改为必填选项
二、系统
1、云平台新增切换语言功能，支持中文和英文版本；
V5.4.1.250625
更新日期：2025年06月25日
更新内容:
一、资源总览
【我的数据库】和 【我的基因集】： 新增部分非模式物种数据库；
【我的项目-分析流程】：
- 实例回收时，增加同步保存快照功能；
- 删除项目或流程时，支持同步删除流程生成的亚群数据及基于该亚群数据创建的流程；
- 亚群的tissue继承大群的
- 增加细胞注释，差异富集和特征分析汇总记录，以及结果总览的删除记录；
- 优化异步接口
- 优化复制流程；
【分析流程-基础分析】：
- 优化seekARC数据初始化速度和数据存储；
- 优化初始化后全局参数调用逻辑；
- 优化推荐RPCA替代CCA方法；
【分析流程-画图工具】：优化小提琴图、DimPlot和FeaturePlot绘图数据大小；
【分析流程-差异富集】： 【汇总】时，支持多个比较方案同步汇总；新增 【中止】功能，可中止差异富集方案任务；优化火山图；
【分析流程-高级分析】：
- mut,rMAST,Fusion,lncCoExpression的样本信息参数默认填充；
- ATAC_Peak2Gene，删除物种参数；
- cytotrace去掉页面downsample和downsample_num两个参数；
【分析流程-辅助信息】：meta.data改成合并亚群注释，merge.metadata改成合并列；
二、系统
【登录】：优化更改密码提示逻辑；
【首页-资料库】：模板库支持下载 Jupyter 模板；
V5.3.1.250529
更新日期：2025年05月29日
更新内容:
一、资源总览
【我的数据】：新增合同编号和流程成员（管理员权限）列；新增关联数据功能（渠道管理员权限）；
【分析流程】：流程页面右下角新增汇总列表，记录该流程所有的汇总记录；修复亚群有分组时，初始化后未使用Sample的bug；优化流程启动和关闭的速度。
【我的数据-数据上传】：新增obj是否可以做downsample的判断；
【分析流程-基础分析】：优化初始化和过滤后小提琴图；新增已选择数据的数量统计；
【分析流程-细胞注释】：点完SingleR注释或SingleR+AI注释按钮后，分组名称无法修改，同时新增下载注释表格功能；
【分析流程-画图工具】：优化降维图，Featureplot图和小提琴图的绘图数据；优化分组热图，支持分组排布；
【分析流程-差异富集】：展示差异和富集分析的任务id；
【分析流程-交互分析】：切割后，样本标签仅支持英文字母、数字、下划线、空格，且英文字母或者数字开头
【分析流程-结果总览】：优化云分析结果总览的fastp报告获取方式；
【分析流程-高级分析】：
- scVelo：支持批量上传loom功能（样本名.loom，zip压缩包格式）；
- BCR/TCR：计算方法和分组因子不互斥；
- 新增CopyscAT，ataCNV，epiAneufinder，ATAC_Monocle3，rMATs，Fusion，mut和LncCoExpression高级分析；
- 新增流程类型(processType)参数。优化高级分析，支持seekARC数据分析；
二、系统
【首页】：登录和注册账号时，支持邮箱或者手机号验证；
V5.2.1.250415
更新日期：2025年04月15日
更新内容:
一、资源总览
【样例项目】：新增ARC（PBMC样本）的样例项目；
【我的数据-数据上传】：支持标准分析 rds 中的 meta.data 没有 Sample 列；
【我的项目-分析流程】：复制流程时，同步复制GSEA结果图和高级分析中的regulon.txt与meta.txt文件；
【分析流程-细胞注释】：AI注释时，输入组织信息进行AI注释；
【分析流程-画图工具】：工具栏中，新增图例放置右侧功能；
【分析流程-富集分析】：优化下载的差异基因表格和富集表格名称；
【分析流程-高级分析】：scenic、monocle2、GSVA和group_diffenrich基于历史分析续跑的删除导出参数按钮；
- diffenrich：物种新增others，选择后仅支持差异分析；
- scVelo删除物种参数；
- 新增CellCharter，SpaGene，cellphonedb_spatial，COMMOT和MISTy空间模块；
- Banksy_SpatialClustering的lambda的范围限制在0到1之间；
V5.2.1.250320
更新日期：2025年03月20日
更新内容:
一、资源总览
【我的项目-个性化分析】：挂载了BACKUP（oss）、/PROJ2/FLOAT/用户和project（NAS）三个盘，用户可以在project下做数据分析；新增 【挂载】按钮，支持已开启的jupyter重新挂载或卸载数据；权限优化；
【我的项目-分析流程】： 【复制】流程时，流程类型一起复制；
【分析流程-基础分析】：RNA整合新增RPCA方法；初始化时的分组或样本，支持数字开头；
【分析流程-画图工具】：添加图组中，新增自动编排-基因集画图功能，可绘制基因集中所有基因或打分的结果；
【分析流程-富集分析】：GSEA方法的全部差异富集结果中新增ES峰图结果，支持选择通路后重新绘图；分组功能支持数字开头；gsea得到的气泡图和柱状图，按照NES的绝对值大小排序；自定义ORA和GSEA通路绘制气泡图和柱形图时，弹窗内的表格可以看到全部的富集表格列；校验方法新增presto、差异表格新增平均表达量列；
【分析流程-高级分析】：
- stlearn：筛选对象参数只能选一个，新增细胞类型参数；
- infercnv：基因最小平均表达量数值限制大于等于0.01；
- CellChat_spatial：优化seekSpace类型数据的CellChat分析；
- monocle3、infercnv、scenic、monocle2、DiffEnrich、CytoTRACE、CellChat、scMetabolism、scVelo、scoring、group_diffenrich、Augur和hdWGCNA 删除分析类型参数
- ATAC_DiffEnrich：新增ATAC数据类型的基因和peak差异分析；
- GeneActivity：新增ATAC数据类型的基因活性分析；
- 新增参数 cloneType计算方法（ct）参数，默认Sample
二、系统
【智能咨询】：优化PC端和移动端的业务逻辑、页面美化、回复内容和功能；删除在线咨询按钮；该功能按钮移到了智能助手AI回复消息下；移动端链接：https://xunxiaoyin.seekgene.com/#/mobileChat
V5.2.1.250226
更新日期：2025年02月26日
更新内容:
一、资源总览
【分析流程-差异富集】：GSEA的结果按照NES列从大到小排序；差异分析新增presto软件，可加快分析进度；差异表格新增基因的平均表达量；
V5.1.1.250218
更新日期：2025年02月18日
更新内容:
一、资源总览
【分析流程-数据上传】：标准分析结果类型数据，校验上传文件的名称只支持英文字母、数字和下划线
【分析流程-细胞注释】：新增SingleR+AI注释（同时使用SingleR和cluster top20的基因基于大语言模型进行注释，支持人工选择最终注释）；大鼠的ref_Mouse_all改为ref_Rat_all；
【分析流程-富集分析】：报告中富集结果的图片名称新增数据库字符串；
【分析流程-高级分析】：新增流程类型参数，基于分析的数据类型（比如scRNA，scRNA+VDJ等）控制可以使用的高级分析内容；
- BCR、TCR和scVelo增加解冻功能；
- float任务名称添加项目id-流程id-高级分析id信息；
- 支持jp_envs路径下的环境
二、系统
【智能咨询】：支持基于寻因数据库的问答和细胞注释，可完成实验、生信、云平台等诸多问题答疑；（右下角的智能咨询功能）
V5.1.1.250116
更新日期：2025年01月16日
更新内容:
一、资源总览
【分析流程-基础分析】：限制 【分组】填写规则，只能输入英文，数字和下划线，且英文开头；优化跳过过滤的提示信息；
【分析流程-画图工具】：小提琴图工具栏中，新增显示内部箱型和显示均值线参数；
【分析流程-差异富集】：小提琴图和热图，对照组在前，实验组在后；优化热图和小提琴图文字大小；
【分析流程-高级分析】：
- 新增hdWGCNA；
- monocle3：downsample必填
- cellchat：分组因子与筛选因子互斥；筛选因子改成分组比较，筛选对象改成比较对象；细胞类型校验至少选择2个类型，新增全部删除功能；
- NicheNet：分组因子与分组比较互斥
- monocle3、infercnv、scenic、monocle2、DiffEnrich、CytoTRACE、scMetabolism、scVelo、scoring和group_diffenrich分析类型的下拉框去掉10X_Visium
【分析流程-辅助信息】：新增格式转换功能，支持metadata的某列转换为字符型或数值型；raw_Sample列不可删除，不可修改；
V5.1.1.250102
更新日期：2025年01月02日
更新内容:
一、资源总览
【分析流程-基础分析】：优化空间样本初始化无法修改Sample的bug；
【分析流程-细胞注释】：细胞注释分辨率列表，至少保留一个分辨率结果；使用全部基因计算Fold Change；添加分辨率功能优化成异步接口；gene列支持精确搜索；兼容ATAC和RNA多组学结果注释与绘图；
【分析流程-画图工具】：兼容ATAC数据降维结果可视化；
【分析流程-差异富集】：差异基因阈值，最小值调整为0.001；
【分析流程-交互分析】：新增ATAC峰图，兼容ATAC数据降维结果可视化；
【分析流程-高级分析】：新增Augur分析内容，用于寻找最先对实验条件做出响应的细胞群；
【分析流程-辅助信息】：metadata、上传合并meta和复制列三个功能，校验覆盖云平台特定字段的优化；meta.data将大群标签合并到亚群，不引入NA；
二、系统
【资料库】：新增云平台高级分析视频；
【登录页】：优化提示用户重新登录的信息；
【AI助手】：新增细胞marker的ai助手；
【marker】：Cell_Marker列支持精确搜索；
V4.4.1.241219
更新日期：2024年12月19日
更新内容:
一、资源总览
【参数模板】：新增ATAC的参数模板；寻因推荐、SeekSpace和ATAC的参数模板，增加线粒体基因集过滤，阈值为0-20；
【分析流程-基础分析】：支持寻因生物scATAC的基础分析（单样本和多样本整合）；
【分析流程-细胞注释、特征分析、画图工具、差异富集和交互分析】：限制输入框，不能输入基因等特殊字符；
【分析流程-高级分析】：
- NicheNet：<处理组>与<对照组>互斥；
- TCR、BCR和scVelo：新增匹配不到数据情况的处理方法（联系销售申请释放在上传）；优化TCR和BCR的查看参数；BCR新增参数因子类型（sub_celltype），可选择特定亚群进行分析；
- monocle3：新增参数downsample：默认填充False；
二、系统
【学习天地】：将数据库添加到学习天地中；
V4.4.1.241204
更新日期：2024年12月04日
更新内容:
一、资源总览
【参数模板】：寻因推荐和 SeekSpace 参数模板聚类去掉分辨率 0.8 和 PCA 维数 30；寻因推荐颜色模板扩充到 60 个；
【分析流程】：优化同一时间大量 【启动】导致启动失败的bug；新增celltaxonomy数据库marker表格，并支持创建基因集；
【分析流程-基础分析】： 【初始化】时新增冷存判断提示；支持cluster数小于等于60的数据分析；
【分析流程-画图工具】：优化图例与标题重复的bug；云分析隐藏样本整合降维图标签；
【分析流程-差异富集】：差异分析的火山图、热图和小提琴图的绘图基因由50个改成20个；富集参数说明中，新增云平台默认支持的物种列表；
【分析流程-结果总览】：优化空间报告标题、描述信息、表注信息和图注信息，新增实验操作和method内容；
【分析流程-辅助信息】：标签管理中，新增上传合并meta和复制列
【分析流程-高级分析】：Diffenrich优化标注描述；减少infercnv和monocle2分析时长；GSVA默认downsample
V4.4.1.241120
更新日期：2024年11月20日
更新内容:
一、资源总览
【我的项目】：优化项目创建人+项目成员均可以搜索到项目的bug；
【我的数据】：seekspace只关联标准分析结果；
【我的数据-数据上传】：新增删除样本的提示；用户账号失效/延期后，用户上传数据的到期时间也同步修改；
【我的流程-基础分析】：分组列表，根据样本名进行排序；
【分析流程-细胞注释】：页面删除分辨率等结果，对应文件也删除；
【分析流程-画图工具】：开放画图工具三个自动编排的使用（生信-技术权限），可用于自动绘制分析报告中的图片；dotplot新增设置表达量阈值功能；降维图和Featureplot图，新增矢量图参数，默认否；
【分析流程-特征分析】：新增大鼠预制基因集；
【分析流程-差异富集】：页面删除比较方案等结果，对应文件也删除；比较组合默认选择第一个；以完成的比较组合，仅支持查看分析参数，不支持再次提交；新增downsample参数为否时的提示；
【分析流程-结果总览】：报告中的header文字优化；
【分析流程-高级分析】：cellchat分析结果优化；
二、系统
【登录页】：优化登录页面提示；
【个人信息】：修改密码手机号等，新增验证码功能；
V4.4.1.241106
更新日期：2024年11月06日
更新内容:
一、资源总览
【分析流程-个性化分析】：支持针对云平台结果进行代码的分析（内部权限）
- 模板库：新增模板库，可将 .ipynb 文件上传到私有和公有库中，并支持删除自己上传的模板；也可从模板库中拉取分析模板；同时模板支持直接预览并可从主页「资料库-分析/文档」进行预览；
- Jupyter 链接：数据分析列表新增【详情】按钮，点击后跳转到 Jupyter 页面；
- 重置资源：允许用户申请对应计算节点，当有jupyter在线时，会先关闭当前节点再开通新节点；
- 获取链接：点击【获取链接】后，可以获取文件oss地址，或者回推到lims对应批次的结果文件中；
- 汇总结果：点击【汇总】，可将文件汇总到对应流程结果总览的「个性化分析」中；
- 日志管理：新增个性化分析日志和使用费用；
【分析流程-辅助信息】：meta.data列表只显示当前项目下的流程；
【分析流程-高级分析】：新增Banksy_SpatialClustering分析，介绍可参看高级分析FAQ中的Q9；
二、系统
【数据删除】：
- 样例项目删除：拉取30天后，页面自动删除（删除前7天发送邮件提醒下载数据）；
- 流程彻底删除：在页面已删除的全部流程（包括上述样例项目流程），页面删除30天后，删除数据库和oss文件；
V4.4.1.241016
更新日期：2024年10月16日
更新内容:
一、资源总览
【参数模版】：差异默认不downsample；差异判断条件新增p_val类型；
【分析流程-差异富集】：
- 比较方案：新增分析进度；修复新建方案比较组合搜索后，无法点击切换顺序的bug
- 表格优化：差异分析表格展示type列；富集结果表格默认用count排序；GO,KEGG结果，点击term可展示基因集ID；
- 图片优化：火山图图例顺序调整（up/down/no-sig）；新增富集分析柱状图；优化下载的图表名称（方案名_细胞类型_比较组合_上下调类型_表格类型/图片类型）
- 分析参数：log2FC默认设置成0；新增整体GO选项及绘图
【分析流程-高级分析】：BCR和TCR新增分析批次编号下拉框，可根据批次编号选择结果文件，同时去掉文件的路径信息
【分析流程-结果总览】：删除基础分析中的图片结果，流程信息中新增实验操作和生物信息分析流程图和描述信息；新增method文档；
V4.4.1.240912
更新日期：2024年09月12日
更新内容:
一、资源总览
【我的项目】：项目列表自定义增加合同编号、合同名称和描述
【分析流程-基础分析】：修复做到过滤后流程重启的bug；
【分析流程-交互分析】：支持多样本展示
【分析流程-高级分析】：
- BCR和TCR：新增批量上传配置功能；
- GSVA：新增downsample参数，基因集限制只能选择1个；
- scenic：优化根据历史任务名称参数，设置Regulon参数下拉选项；
- scMetabolism：分析方法去掉gsva和ssgsea；
二、系统
【首页】：新增云平台首页，包括公告、资料库（学习视频、分析代码、demo数据等）、项目文章等、用户类型等内容；
V4.4.1.240821
更新日期：2024年08月21日
更新内容:
一、资源总览
【我的数据-数据上传】：支持批量上传（生信和渠道权限）；有效期与账号保持一致；删除上传数据时，保留上传记录，并删除数据；
【我的项目-分析流程】：优化上传的rds，获取自带分辨率
【分析流程-细胞注释】：参考集中的细胞名称中的-换成_
【分析流程-画图工具】：新增AI绘图；优化绘图基因多导致的超时提示信息
【分析流程-高级分析】：CytoTRACE和copyKAT新增downsample参数
二、系统
【配色方案】：连续型颜色支持设置多种颜色；
【用户管理】：标准分析和云分析项目合同用户，可使用全部模块，质控项目用户，仅可使用基础分析、细胞注释、画图工具、交互分析和结果总览；
V4.4.1.240731
更新日期：2024年07月31日
更新内容:
一、资源总览
【我的项目-分析流程】：流程列表中新增更新时间并且按照更新时间排序；
【我的数据】：优化数据细胞数，根据标准分析和上传的数据计算和展示细胞数。历史数据中，如果没有，默认每个样本1w；
【分析流程-基础分析】：优化我的数据库和我的基因集结构；
【分析流程-细胞注释】：优化基因集绘图时的横坐标排序；参考集中的细胞类型名称中，/替换成_or_，+替换成空格；
【分析流程-画图工具】：分组因子和拆分因子里的标签按英文字母顺序或数字大小排；
【分析流程-差异富集】：增加运行中的任务可查看参数功能；
【分析流程-高级分析】：新增导入参数功能，支持历史任务参数一键导入；cellphonedb细胞类型必须选择1种以上；scenic的regulon参数，改成下拉框，选择后可进行 二次分析；
【分析流程-辅助信息】：meta.data页面，新增先选择流程状态为在线的大群流程，再选择亚群流程的提示；
二、系统
【参数模板】：以Range方式按基因集表达比例过滤，默认阈值改成0～10；
V4.4.1.240717
更新日期：2024年07月17日
更新内容:
一、系统
【用户管理】：新增渠道管理员用户、渠道用户、渠道子用户角色和权限，其中渠道管理员和渠道子用户未上下级关系，具有创建、分配上传数量、回答问题等功能；
V4.4.1.240710
更新日期：2024年07月10日
更新内容:
一、资源总览
【我的数据-数据上传】：新增上传人字段；
【分析流程-画图工具】：饼图新增排序参数，按照分组因子顺序绘图；
【分析流程-差异富集】：新增比较方案的完成时间
【分析流程-高级分析】：scVelo、TCR、BCR 【查看】中新增删除按钮；删除scVelo的筛选因子和筛选对象参数；优化高级分析数据存储
【分析流程-个性化分析】：新增模板数据库，支持上传和下载jupyter模版。
二、系统
【配置管理】：优化配置管理中图片存储；
【样例项目】：空间样例项目替换成1092样本；
V4.4.1.240626
更新日期：2024年06月26日
更新内容:
一、资源总览
【分析流程-基础分析】：基础分析完成时，新增保存快照功能；
【分析流程-差异富集】：差异富集分析的结果默认优先展示所有差异；优化GSEA方法多次分析结果保持一致；交互的柱状图和热图、小提琴图顺序一致；
【分析流程-辅助信息】：meta.data列表新增"流程编号"列；
【分析流程-高级分析】：
- 高级分析列表新增一列分析完成时间；新增高级分析完成后发送提醒邮件信息；
- 新增scoring和group_diffenrich两种高级分析；
- 优化Monocle的state参数设置；
- 优化scVelo参数设置；
- copyKAT和scVelo：拆分因子改成筛选因子，拆分对象改成筛选对象；
- 优化Diffenrich、monocle3、CytoTRACE、infercnv、scMetabolism、scVelo：分析类型参数；
- infercnv新增大鼠物种
【分析流程-交互分析】：优化网络过慢情况下频繁切换select选项导致结果不一致（禁止频繁点击）
二、系统
【个人信息】：新增设置报告logo，邮箱，电话，高级分析报告题目功能（渠道用户权限）；
【个人信息】：AI手机端页面美化；
【样例项目】：样例项目，去掉流程成员；
【参数模板】：寻因推荐参数模板中，umi最小值从300改成200；
V4.4.1.240613
更新日期：2024年06月13日
更新内容:
一、、资源总览
【我的数据-数据上传】：rds文件根据Sample计算样本数量，并自动扣除可上传数量；支持最大细胞数为50w；
【分析流程-基础分析】：基因集过滤结果保存到metadata；
【分析流程-细胞注释】：基因表达量图按照细胞名称顺序排序；
【分析流程-画图工具】：自动调整spatial图片宽度；气泡图新增拆分因子参数；
【分析流程-交互分析】：支持下载png和svg图片，图中增加比例尺和图注；
【分析流程-高级分析】：
- GSVA中<分组因子>与<分组比较>标签互斥；
- CytoTRACE的<细胞类型>至少选择2种及以上，拆分因子和拆分对象改为筛选因子和筛选对象；
- monocle3、cellphonedb和infercnv的物种由拉丁改成英文，并优化输入框问题提示；
- 优化monocle2参数默认设置；
- 优化infercnv分析资源配置；
- cellchat页面新增提示信息CellChat需执行2步才可得到结果，详情看FAQ的Q5；
- 优化高级分析发送报错逻辑；
【分析流程-结果总览】：
- 自动注释结果位置调整；
- 测序质控，文库质控，样本信息新增图表名称列；
- 优化「差异富集」模块ora和gsea《富集结果》的表注；
【分析流程-辅助信息】：下载的空间rds文件，保存he和ssdna的png图片
二、系统
【在线咨询】云平台新增 AI 智能问答功能，初次咨询时 AI 回答，可选择人工回复；手机端 AI 首页增加提醒文字，首页美化后会添加到公众号中；
V4.3.1.240522
更新日期：2024年05月22日
更新内容:
一、资源总览
【我的数据-数据上传】：校验rds文件必须同时包括umap和tsne降维；meta.data必须包括Sample列；优化umap降维名称；
【分析流程-分析流程】：优化无法启动的流程报错信息
【分析流程-交互分析】：
- 新增图片位置调整功能；新增返回上一步或原始状态功能
- 新增切割的还原功能，可返回上一步或原始状态（调整和切割均视为对图片的调整）
- 优化页面样式
【分析流程-高级分析】：增加任务id列；优化任务删除逻辑
- infercnv <分析细胞类型>必选，与<参考细胞类型>互斥
- monocle2 <细胞类型>必须选择2种及以上细胞类型；筛选因子选填；新增downsample功能，分析类型字段优化调整
- monocle3 <拆分因子>必填，历史记录增加细胞类型参数；
- scenic 新增downsample功能，分析类型字段优化调整
【分析流程-结果总览】：优化差异富集结果中，细胞名称太长导致无法删除的情况
【我的数据库-我的基因集】：基因集物种支持搜索选择
V4.2.1.240508
更新日期：2024年05月08日
更新内容:
一、云平台-资源总览
【分析流程-数据上传】：rds的metadata不能含NA，matrix的Barcode中去掉了路径；
【分析流程-细胞注释】：优化基因集结果缓存；
【分析流程-差异富集】：根据富集方法参数，优化GSEA和ORA导入结果总览的表头；
【分析流程-交互分析】：离散型颜色，随着画图工具的配色方案同步修改，新增调整HE图片颜色组合按钮；
【分析流程-辅助信息】：标签管理中，Sample、以resolution开头的列，去掉编辑功能；
【分析流程-高级分析】：优化cellphonedb 、GSVA和copyKAT分析流程，优化monocle2续跑逻辑；
【分析流程-结果总览】：参数统计中，新增自动注释的参数；所有绘图结果堆叠展示；优化质控文库，测序文库列表；
二、系统
【链接登录】：点击流程链接，登录后可直接跳转到对应流程中；
【用户管理】：新增第三方管理员功能，可单独查看从第三方访问和注册的用户数量和名单；
V4.2.1.240424
更新日期：2024年04月24日
更新内容:
一、系统
【配置管理】：优化参数和FAQ
V4.1.2.240417
更新日期：2024年04月17日
更新内容:
一、资源总览
【分析流程】：优化流程编号规则；
【我的数据-数据上传】数据上传大小限制5G；
【分析流程-画图工具】：小提琴图共享y轴默认关闭；
【分析流程-结果总览】：增加用户下载历史报告功能；内容描述优化，
【分析流程-交互分析】：新增HE背景图和图片的切割
二、系统
【在线咨询】：优化用户与技术支持的绑定关系
【流程管理】：优化管理员的复制和共享权限
V4.1.1.240320
更新日期：2024年03月27日
更新内容:
一、资源总览
【我的数据-数据上传】：增加标准分析结果的说明
【分析流程-交互分析】：新增ssDNA图片切割和替换功能
【分析流程-高级分析】：
- 优化monocle3、monocle2、scenic、cellphonedb，Diffenrich参数；
- 在基于历史结果重分析时，优化参数填充逻辑；
- Cellchat的配体细胞和受体细胞限制为细胞类型的子集；
- 新增copyKAT，scMetabolism，GSVA，NicheNet，scVelo分析类型；
【分析流程-结果总览】：新增流程链接，新增质控相关的数据
二、系统
【用户管理】：优化用户管理功能
【在线咨询】：优化未读消息数量提醒
【使用说明】：高级分析、标签管理使用说明的更新与新增
【配置管理】：新增CellChat使用教程，「特征分析」与创建基因集的区别
V4.0.20.240306
更新日期：2024年03月06日
更新内容:
一、资源总览
【我的项目-样例项目】：样例项目新增空间流程
【分析流程】：流程新增流程编号
【分析流程-细胞注释】：标签的输入框，限制不能输入基因名等特殊字符；
【分析流程-基础分析】：优化CCA报错提示文字，优化 【完成】时的蒙板状态逻辑
【分析流程-细胞注释】：细胞名称只能输入数字、字母、下划线和空格；
【分析流程-画图工具】：小提琴图新增表达量统计表，所有类型图片图例位置优化；
【分析流程-高级分析】：增加BCR、TCR、CytoTRACE和CellChat的参数说明；
【分析流程-辅助信息】：新增标签管理功能；
V4.0.18.240124
更新日期：2024年01月24日
更新内容:
一、资源总览
【我的数据-数据上传】：数据上传兼容features.tsv.gz只有一列的情况；优化数据上传提示，页面新增权限数量；
【分析流程】：流程新增流程成员列，可对流程单独设置权限；
【分析流程】：基因集验证（细胞注释、差异富集、画图工具等），统一提示信息；
【分析流程-画图工具】：小提琴图中新增检验方法字段，可设置隐藏/显示；dotplot图新增统计表，y轴文字长度超过50换行；热图图注和标注修改；
【分析流程-亚群选择】：生成的数据，项目成员间可共享；
【分析流程-差异富集】：富集气泡图的颜色范围根据padj范围自动设置；
【分析流程-高级分析】：高级分析新增CytoTRACE和CellChat；
【分析流程-结果总览】：调整「参数统计」位置；
V4.0.17.240111
更新日期：2024年01月11日
更新内容:
一、资源总览
【分析流程-基础分析】：基础分析新增单样本过滤统计表；流程初始化新增基础分析-细胞注释-画图工具-差异富集功能；
【分析流程-高级分析】：scenic分析支持基于历史结果重分析功能；优化DiffEnrich；
【分析流程-结果总览】：优化结果汇总字体、图片大小等；
二、系统
【注册和登录】：登录和注册页，新增云平台用户政策和隐私协议；
V4.0.16.231227
更新日期：2023年12月27日
更新内容:
一、资源总览
【分析流程】：流程新增合同编号与名称，支持可修改；所有模块添加参数说明和FAQ
【分析流程-基础分析】：过滤中，自定义基因集小提琴图支持导入结果总览；
【分析流程-细胞注释】：细胞注释的marker基因表格，列名logFC改成log2FC；
【分析流程-画图工具】：新增自定义自动编排；
【分析流程-差异富集】：差异富集模块中，柱状图汇总到结果总览拆分成比较对；
【分析流程-交互分析】：新增画线矩形进行数据统计展示；优化数据处理逻辑，加速数据处理；
【分析流程-高级分析】：高级分析新增TCR和BCR联合分析
【分析流程-结果总览】：同级标题可移动；
【辅助信息】中样本表移动到【结果总览】；
V4.0.15.231213
更新日期：2023年12月13日
更新内容:
一、资源总览
【我的项目-样例项目】：样例项目，高级分析更新为新版报告；
【分析流程-基础分析】：优化CCA整合失败提示信息；页面新增参数说明和FAQ文档
【分析流程-细胞注释】：细胞注释提示信息优化，当只有一种细胞类型时，无法分析和保存；
【分析流程-差异富集】：差异结果热图的顺序与比较组合顺序保持一致；富集分析terms名字改成小写；
【分析流程-交互分析】：新增因子全选、页面全屏功能；标记细胞的metadata输入框改成的下拉框，可输入也可选择；
【分析流程-高级分析】：高级分析scenic模块，支持单细胞类型分析；修改报告下载命名规则；
V4.0.12.231130
更新日期：2023年11月30日
更新内容:
一、资源总览
【参数模板】：调整寻因推荐参数设置；
【我的项目】：我的项目列表以更新时间排序；添加云平台引导内容，从资源总览引导到创建流程；
【我的数据-数据上传】：新增分享功能，可将上传的样本分享到其他账号中；
【分析流程】：云平台所有物种，改成拉丁名(英文名)形式；
【分析流程-基础分析】：优化初始化选择的样本顺序；提升基础分析页面加载效率；
【分析流程-细胞注释】：优化分辨率删除逻辑；
【分析流程-画图工具】：设置中添加Arial字体；
【分析流程-特征分析】：特征分析的汇总，点击之后，加了一个蒙版；
【分析流程-差异富集】：在比较组合下方，添加一个搜索框，支持客户进行检索；
【分析流程-交互分析】：新增交互分析模块，可用于转录组与自研SeekSpace空间产品联合分析；
【分析流程-高级分析】：新增cluster间的差异富集分析（Diffenrich）；
【分析流程-结果总览】：优化差异富集结果顺序；
二、系统
【登录】：云平台登录页面，新增密码找回功能；一个账号同时只能在一台电脑上登录；
【用户管理】：优化账号过期邮件格式和数据释放邮件格式；
V4.0.12.231101
更新日期：2023年11月15日
更新内容:
一、资源总览
【参数模板】：寻因推荐参数模版，新增GO、KEGG和REACTOME数据库；基因集过滤，默认为空；
【分析流程】：所有导入按钮，导入改成汇总，下载图形按钮改成文字按钮；所有新建图形按钮，改成了文字按钮；优化流程右上角状态，保持实时更新；
【我的数据-数据上传】：优化matrix类型，支持多选数据。
【分析流程-基础分析】：优化基础分析进度条，新增提示时间；
【分析流程-细胞注释】：top基因弹窗中，新增获取top基因生成基因集功能；优化 修改注释弹窗表格，下载的文件名称添加项目、流程等信息
【分析流程-画图工具】： 【添加标签】功能，可以按照基因表达量进行标记；
【分析流程-特征分析】：图片支持导入结果总览；
【分析流程-解雇总览】：差异富集表格下载文件名称添加流程、分组、比较对等信息；报告文字修改和结构优化；
二、系统
【在线咨询】优化在线咨询逻辑；
【配置管理】新增配置管理，用于页面的参数说明和结果说明等；
V4.0.11.231018
更新日期：2023年10月18日
更新内容:
一、资源总览
【我的数据库】：数据库绑定基因集；
【分析流程】：流程内可以随时编辑名称，描述；
【分析流程-基础分析】：流程中自动匹配对应物种数据，无法匹配则置空，并进行提示；
【分析流程-细胞注释】：细胞注释和差异富集页面，可以按比例缩放，加一个缩放按钮
【分析流程-画图工具】：支持调整分组因子和拆分因子顺序，新增调整配色功能；
【分析流程-差异富集】：增加自定义绘制富集气泡图功能；
V4.0.10.230927
更新日期：2023年09月27日
更新内容:
一、资源总览
【分析流程-画图工具】增加修改字体功能；增加features清空功能；
【分析流程-辅助信息】下载链接转为临时链接
二、系统
【在线咨询】：新增在线咨询功能；
【权限设置】流程增加用户权限设置；
V4.0.9.230920
更新日期：2023年09月20日
更新内容:
一、资源总览
【我的项目】：优化共享的账号匹配逻辑；
【我的数据库】：添加数据库或基因集时，默认使用原名称，可编辑
【分析流程】：优化物种信息配置；
【分析流程-基础分析】：优化基础分析完成逻辑；修改过滤页面的应用不重置结果的bug；
【分析流程-细胞注释】：优化保存细胞注释结果逻辑；细胞注释表格支持下载，新增导入 【结果总览】功能；注释参考集增加分类标签；
【分析流程-差异富集】：差异富集结果汇总增加蒙板；
【分析流程-亚群选择】：新建亚群流程时，自动选择对应数据；
【分析流程-高级分析】：优化高级分析执行环境；优化infercnv参数；
【分析流程-辅助信息】：优化数据下载逻辑；
【分析流程-结果总览】：结果总览中，基础分析图片点击后，可以跳转至对应模块位置
V4.0.8.230906
更新日期：2023年09月06日
更新内容:
一、资源总览
【参数模板】：颜色模版，连续颜色换成灰到蓝；
【分析流程】：新增流程复制功能；
【我的项目-样例项目】：新增转录组样例项目；
【分析流程-结果总览】：原数据探索修改成结果总览，优化报告目录结构和功能；
【分析流程-差异富集】：新增比较方案时，支持新建比较组。支持一键导入比较方案结果功能；
【分析流程-辅助信息】：辅助信息下载数据增加权限，技术支持和客户无权下载数据；
二、系统
【登录】：调整注册用户使用权限；
【页面布局】：标题栏新增自定义风格；界面美化；
V4.0.7.230823
更新日期：2023年08月23日
更新内容:
一、资源总览
【我的数据库】：优化我的数据库和基因集物种选择逻辑；
【分析流程-细胞注释】：优化自动注释逻辑；统一featureplot于降维图的降维方式；新增基因表格下载功能；
【分析流程-差异富集】：优化差异基因图片与表格对应关系；新增差异富集表格下载功能；
【分析流程-画图工具】：新增菜单栏；
二、系统
【登录】：新增注册功能；注册用户权限调整；增加手机号验证功能；
【用户管理】：调整显示的账号信息；优化创建和到期功能逻辑；
【页面布局】：页面UI美化；
V4.0.6.230809
更新日期：2023年08月10日
更新内容:
一、资源总览
【分析流程-高级分析】：增加monocle2模块；
【分析流程-差异富集】：支持组间差异富集分析，生成细胞注释、差异富集模块报告
【分析流程-基础分析】：新增基础分析+细胞注释，基础分析+细胞注释+差异富集分析自动编排；优化基础分析进度自动刷新；
【分析流程-画图工具】：新增描述功能；基因默认收缩，可点击展开；
二、系统
【参数模板】：新增差异和富集的参数；新增自定义颜色功能；
【页面布局】：界面主题美化；
【资源设置】：优化资源，支持大数据量分析（20w左右）；
V4.0.5.230703
更新日期：2023年07月03日
更新内容:
一、资源总览
【我的数据-数据上传】：兼容辅助信息下载的rds文件；
【分析流程-细胞注释】：模块更新升级；
【分析流程-基础分析】：新增一键化分析功能；优化使用说明文档；
【分析流程-画图工具】：小提琴图新增显著性统计、features参数新增新建基因集功能；
【分析流程-特征分析】：新增添加特征集功能；
【分析流程-差异富集】：富集分析选择绝对值的bug优化；
【分析流程-高级分析】：优化高级分析资源；infercnv使用全部细胞；
V4.0.4.230609
更新日期：2023年06月09日
更新内容:
一、资源总览
【资源总览】：优化我的数据库、我的基因集、参数模板和使用说明功能；
【我的数据】：包括原始矩阵、样本、亚群和标准分析结果四种；
【分析流程-基础分析】：优化基础分析页面布局和逻辑，基础分析完成前，所有步骤均可重复操作，标准rds初始化之后允许跳过整合/聚类，参数和动图颜色均来源于选择的模版；
【分析流程-画图工具】：优化分组和图片排序功能；features支持拖动排序；分组因子支持单选和多选；优化分组因子和拆分因子展示形式，优化绘图数据；新增饼图绘图方式；
更新日期：2023年05月11日
更新内容:
一、资源总览
【资源总览】：新增我的数据库、我的基因集、参数模板和使用说明功能
【分析流程-画图工具】：数据探索更新为画图工具；
二、系统 【登录】登录地址改用域名；
V4.0.1.230420
更新日期：2023年04月20日
更新内容:
一、资源总览(原分析项目):
【分析项目】：《分析项目》改为《资源总览》，优化页面结构，新增"我的项目"和"我的数据"列表，修改和新增 【创建项目】和 【快速创建流程】按钮；调整数据上传逻辑；
【我的项目】：新增项目共享功能，优化项目编号规则；
【分析流程】：流程列表美化，新增关闭流程功能；
【分析流程-数据探索】：报告下载添加正在下载提示；
【分析流程-差异富集】：报告下载添加正在下载提示；
二、系统
【列表】：美化列表格式，支持搜索、排序等功能；
V4.0.0.230406
更新日期：2023年04月07日
更新内容:
一、资源总览
【分析项目-数据探索】新增分组绘图功能，支持图片在分组内和组间移动；新增图例细胞数统计是否展示功能；新增设置图中标签是否展示功能；新增调整渐变图例范围功能；
【分析项目-差异富集】优化气泡图中Y轴文字排版；
二、系统
【登录】：调整密码5次输错机会，超过5次需要等待30min；
【个人信息】：新增个人信息展示与修改等功能；
【页面布局】：优化云平台页面结构布局；
V3.0.0.230320
更新日期：2023年03月20日
更新内容:
一、资源总览
【分析流程】增加云平台报告表格下载功能，
【我的数据-数据上传】：优化数据上传速度；
【分析流程-画图工具】：新增绘制热图；
【分析流程-特征分析】：特征分析支持多数据集分析；