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发布说明

作者: SeekGene
时长: 2 分钟
字数: 502 字
更新: 2026-05-14
阅读: 0 次
SeekSpace® Tools

v1.0.3

WARNING

版本兼容性提醒: 因 v1.0.3 新增了对真迈新款测序芯片的数据解析支持,本版本不再兼容旧版芯片的数据分析。您可以通过芯片编号的中间六位判断芯片批次信息:例如芯片编号 2P250718026C2 对应的批次信息为 25 年 7 月 18 日,该批次及之后的芯片支持使用 v1.0.3 分析;在此批次之前的芯片,请继续使用旧版软件进行分析。

新增功能

  • 新增对真迈新款测序芯片的数据解析支持。
  • 新增高清 DAPI 图像的导出功能。
  • 引入基于 Scanpy 的聚类分析算法,并支持导出 h5ad 格式结果文件。

功能优化

  • 优化 umitools UMI 纠错策略:增加最大处理阈值限制,当 UMI 数量大于 5000 时跳过纠错,以避免构图过大造成的性能损耗。
  • 修复 Web Summary 报告在过滤细胞后图像显示异常的问题,并新增交互图表散点大小的动态调节功能。

v1.0.2

新增功能

  • 新增组织分割参数调节参数,优化低信号组织区域的识别能力。
  • 优化 Web Summary 界面,实现基因数、UMI 数和线粒体含量过滤的筛选,并实时展示细胞数量变化。

功能优化

  • 重构多进程调度机制,显著提升 CPU 利用率。
  • 增强 GTF 文件解析兼容性:支持无 exon_id 属性的转录本注释,新增基于 type=exon 的外显子识别逻辑。
  • 重新设计 lncRNA 统计算法,修正中位数计算方法。
  • 新增空间转录组数据质控指标:spatial barcode 和 spatial UMI 的 Q30 统计。
  • 优化 filtered_feature_bc_matrix 输出,提取组织区域内的有效细胞空间位置信息。

v1.0.0

首次发布

  • 发布稳定版本,支持空间转录组数据标准分析流程。
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