数据准备

作者: SeekGene

时长: 2 分钟

字数: 342 字

更新: 2026-05-28

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SeekSpace® Tools

测试数据下载

关于测试数据的下载，请参考 示例数据 文档。

空间条形码文件下载 (HDMI FASTQ)

HDMI FASTQ 文件（芯片专属空间条形码；必需）

SeekSpace 空间芯片上的每个捕获区域（Capture Area）都有其专属的条形码参考信息，这些信息以 FASTQ 文件的形式存储。这些文件定义了空间坐标，用于将测序数据准确映射回组织切片。

为了确保空间分析的正确性，在进行分析之前，用户必须根据自己的芯片 ID 和捕获区域 ID 下载相匹配的 FASTQ 文件。如果您不确定您的芯片 ID，请查看芯片上的标签或联系技术支持。

获取链接

参考基因组链接

Download-human-reference-GRCh38 - MD5: 75752934440590827289569e90099408
Download-mouse-reference-GRCm38 - MD5: c784f479d0124238e23547477340b080

wget 下载方式

wget -c -O mm10.tar.gz "https://seekgene-public.oss-cn-beijing.aliyuncs.com/software/data/reference/mm10.tar.gz"
# decompress
tar -zxvf mm10.tar.gz

curl 下载方式

curl -C - -o mm10.tar.gz "https://seekgene-public.oss-cn-beijing.aliyuncs.com/software/data/reference/mm10.tar.gz"
# decompress
tar -zxvf mm10.tar.gz

参考基因组的构建可以参考 如何构建参考基因组？。