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SeekSpace® Tools v1.0.3

作者: SeekGene
时长: 1 分钟
字数: 249 字
更新: 2026-05-14
阅读: 0 次
SeekSpace® Tools

概述

SeekSpace® Tools 是由寻因生物开发的一款用于处理单细胞空间转录组数据的生信分析软件。该软件以 SeekSoul Tools 为内核处理单细胞转录组数据(包括 Cell Barcode 定量、细胞判定及细胞表达矩阵生成),并针对空间组学技术进行了专项扩展。

对于空间文库,SeekSpace® Tools 主要提供以下分析模块:

  • 空间细胞定位:通过解析芯片上空间标签与细胞标签的映射关系,将单细胞定位至芯片物理坐标。
  • 组织图像分割:自动处理组织切片图像,实现组织有效区域与背景的分割。
  • 下游数据分析:对定位成功的细胞执行聚类分析和差异基因表达分析。
  • 空间可视化:将聚类结果与原位组织图像进行重叠展示,实现数据的空间可视化。
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