SeekSoul Tools v2.0.0
时长: 2 分钟
字数: 391 字
更新: 2026-01-26
阅读: 0 次
SeekSoul Tools 是寻因生物开发的一套处理单细胞转录组数据的软件，目前该软件包含六个模块：
rna 模块：用于识别细胞标签 barcode，比对定量，得到可用于下游分析的细胞表达矩阵，之后进行细胞聚类和差异分析。该模块不仅支持 SeekOne® 系列试剂盒产出数据，还可通过对 barcode 的描述，支持多种自定义设计结构。
fast 模块：该模块专门针对 全序列转录组试剂盒产出的数据，用于对数据进行 barcode 提取、双端 Reads 比对、定量，以及全序列数据特有的指标统计。
vdj 模块：该模块专门针对 SeekOne® DD 单细胞免疫分析试剂盒产出的数据，用于组装、过滤和注释免疫受体。
multivdj 模块：该模块用于对 5' RNA 和 VDJ 数据进行联合分析。
probe 模块：该模块专门针对 SeekOne® MLPSeq 单细胞转录组试剂盒产出的数据，用于对数据进行 barcode 提取、比对、定量，得到可用于下游分析的表达矩阵。
utils 模块：该模块包含其他小工具。