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SeekSoul Tools v1.2.2

作者: SeekGene
时长: 2 分钟
字数: 309 字
更新: 2026-01-26
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SeekSoul Tools

SeekSoul Tools 是寻因生物开发的一套处理单细胞转录组数据的软件,目前该软件包含两个模块:

  1. rna 模块:用于识别细胞标签 barcode,比对定量,得到可用于下游分析的细胞表达矩阵,之后进行细胞聚类和差异分析。该模块不仅支持 SeekOne® 系列试剂盒产出数据,还可通过对 barcode 的描述,支持多种自定义设计结构。

  2. fast 模块:该模块专门针对 全序列转录组试剂盒和 SeekOne® DD FFPE 样本单细胞转录组试剂盒产出的数据,用于对数据进行 barcode 提取、双端 Reads 比对、定量,以及全序列数据特有的指标统计。

  3. vdj 模块:该模块用于专门针对 SeekOne® DD 单细胞免疫分析试剂盒产出的数据,用于组装、过滤和注释免疫受体。

  4. utils 模块:该模块包含其他小工具。

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